Pada 19 Februari 2009, Ibrahim Hussein meninggal dunia di Hospital Pantai, Bangsar kerana mengalami masalah jantung. Beliau dimasukkan ke Unit Rawatan Rapi (ICU) sejak 4 petang. Jenazah dikebumikan di Tanah Perkuburan Islam Bukit Kiara. Turut ziarah ialah Timbalan Perdana Menteri Malaysia Datuk Seri Najib Tun Razak, bekas Menteri Besar Kedah Tan Sri Sanusi Junid, Menteri Perdagangan Dalam Negeri dan Hal Ehwal Pengguna Datuk Shahrir Abdul Samad dan Gabenor Bank Negara Malaysia Tan Sri Zeti Akhtar Aziz.